EVENTOS de Capacitação E DISSEMINACAO CIENTÍFICA
ANO 2025
Webinário - Dia Mudial de Combate à Tuberculose 31 de março de 2025: Link para a gravação do evento (em andamento).
Treinamento continuado computacional em Bionformática - 24 encontros online - em andamento.
ANO 2024
ESTADO DO AMAZONAS
Período: 11 a 14 de novembro de 2024. Feriado no dia 15.
Dia do Workshop: 11 de novembro de 2024, das 08:30 às 12:00.
Local do workshop: Av. Torquato Tapajós, 4.010 - Col. Santo Antônio, Manaus - AM (Auditório da Fundação de Vigilância em Saúde).
Local laboratorial: LACEN-PA: Rua Emílio Moreira 528, Centro, Manaus-AM, 69020-040.
Local Bioinformática: EDUCAR-AM.
Cronograma das atividades:
| Dia | Período | Atividade | Facilitador |
|---|---|---|---|
| 1 | Manhã | Workshop REVIGET: Enfrentamento da tuberculose e micobacterioses no SUS com tecnologias de NGS. 08:30–09:00: Credenciamento (MSc. Alex Brito, MSc. Abhinav Sharma) 09:00–09:10: Abertura (Dra. Adriana Ayden) 09:10–09:30: Mesa (Dr. Marco de Oliveira) 09:30–09:45: P1 “O Projeto Consolidação da REVIGET N/NE” (Dra. Karla Lima) 09:45–10:00: P2 “Situação da Tuberculose no Brasil e no Amazonas” (Dr. Maurício Ogusku) 10:00–10:20: P3 “Diagnóstico de Micobactérias e Tecnologias de NGS” (Dra. Emilyn Costa) 10:20–10:50: Coffee-Break 10:50–11:15: P4 “Acelerando o fluxo de diagnóstico por WGS” (Dra. Emilyn Costa) 11:15–11:45: Q&A (Dra. Adriana Ayden & mesa) 11:45–12:00: Encerramento (Dra. Adriana Ayden, Dra. Karla Lima) |
Grupo REVIGET e convidados |
| Tarde | Inativação, extração do DNA micobacteriano e controle de qualidade. | Emilyn | |
| 2 | Manhã | Normalização do DNA e início do preparo de biblioteca. | Emilyn |
| Tarde | Continuação do preparo de biblioteca. | Emilyn | |
| 3 | Manhã | Finalização do preparo de biblioteca e controle de qualidade. | Emilyn |
| Tarde | Início do sequenciamento; introdução a computadores. | Emilyn | |
| 4 | Manhã | Pipelines e sessão interativa no Gitpod; Pipeline MAGMA no Gitpod. | Abhinav |
| Tarde | Execução do Pipeline MAGMA na plataforma Seqera; interpretação de resultados. | Abhinav | |
| 5 | Manhã/Tarde | FERIADO – Atividade social: visita ao centro histórico de Manaus e ao Teatro Amazonas. | Todos |
ESTADO DO CEARÁ
Período: 18 a 22 de novembro de 2024. Feriado no dia 20.
Dia do Workshop: 21 de novembro de 2024, das 08:30 às 12:00.
Local do workshop: Auditório da Escola de Saúde Pública, Av. Antônio Justa, 3161 – Meireles, Fortaleza – CE.
Local laboratorial: Lacen-Ceará, Av. Barão de Studart, 2405 – Dionísio Torres, Fortaleza – CE.
Local computacional: 1º dia: Escola de Saúde Pública; 2º dia: Sala de aula do Programa de Pós‑graduação em Patologia, Dep. de Patologia e Medicina Legal, FM-UFC.
| Dia | Período | Atividade | Facilitador |
|---|---|---|---|
| 1 | Manhã | Inativação da bactéria, extração do DNA micobacteriano e controle de qualidade; Normalização do DNA e início do preparo de biblioteca. | Emilyn |
| Tarde | Continuação do preparo de biblioteca. | Emilyn | |
| 2 | Manhã | Continuação do preparo de biblioteca. | Emilyn |
| Tarde | Finalização do preparo de biblioteca e controle de qualidade; início do sequenciamento. | Emilyn | |
| 3 | Manhã | Workshop REVIGET: 08:30–09:00: Credenciamento (MSc. Alex Brito, MSc. Thiago Brasil) 09:00–09:10: Abertura (Dra. Cristiane Frota) 09:10–09:30: Mesa (Dra. Cristiane Frota) 09:30–09:45: P1 “Consolidação da REVIGET N/NE” (Dra. Cristiane Frota) 09:45–10:00: P2 “Situação da Tuberculose no Brasil e no Ceará” (Dr. Carlos Garcia Filho) 10:00–10:20: P3 “Diagnóstico de Micobactérias e Tecnologias de NGS” (Dra. Emilyn Costa) 10:20–10:50: Coffee-Break 10:50–11:15: P4 “Acelerando o fluxo de diagnóstico por WGS” (Dra. Emilyn Costa) 11:15–11:45: Q&A (Dra. Cristiane Frota & mesa) 11:45–12:00: Encerramento (Dra. Cristiane Frota) |
Grupo REVIGET e convidados |
| Tarde | Início aos computadores; Pipeline MAGMA no Gitpod e Google Cloud. | Abhinav | |
| 4 | Manhã | Pipeline MAGMA no Google Cloud pela plataforma Seqera. | Abhinav |
| Tarde | Interpretação dos resultados de MAGMA. | Abhinav / Emilyn |
ESTADO DO PARÁ
Período: 25 a 29 de novembro de 2024.
Dia do Workshop: 29 de novembro de 2024, das 08:30 às 12:00.
Local do workshop & Treinamento Laboratorial: Av. Augusto Montenegro, 524 – Parque Guajará, Belém‑PA (Auditório LACEN‑PA).
| Dia | Período | Atividade | Facilitador |
|---|---|---|---|
| 25 | Manhã | Inativação, extração do DNA micobacteriano e controle de qualidade. | Davi e Alex |
| 26 | Manhã | Normalização do DNA e início do preparo de biblioteca (tagmentação, limpeza pós‑tagmentação e amplificação). | Davi e Alex |
| 27 | Manhã | Continuação do preparo de bibliotecas: limpeza, controle de qualidade (Qubit e LabChip). | Davi e Alex |
| 28 | Manhã | Início do sequenciamento: diluição das bibliotecas para 4 nM, pool, desnaturação e diluição com PhiX; configuração do MiSeq e início do sequenciamento. | Davi e Alex |
| 29 | Manhã | Workshop REVIGET: 08:30–09:00: Credenciamento (MSc. Alex Brito, MSc. Emilly Dias) 09:00–09:05: Abertura (Dra. Karla Lima) 09:05–09:15: Mesa 09:15–09:45: P1 “Consolidação da REVIGET N/NE…” (Dra. Karla Lima) 09:45–10:00: P2 “Situação da Tuberculose no Brasil e no Pará” (Dr. Carlos Albério) 10:00–10:15: P3 “Diagnóstico de Micobactérias e NGS” (Dra. Karla Lima) 10:15–10:30: Coffee-Break 10:30–10:45: P4 “NGS a partir do Escarro” (Davi Marcon) 10:45–10:55: Q&A (Dra. Karla Lima) 10:55–11:00: Encerramento (Dra. Karla Lima) |
Grupo REVIGET e convidados |
ESTADO DA BAHIA
Período: 02 a 06 de dezembro de 2024.
Dia do Workshop: 02 de dezembro de 2024, das 08:30 às 12:00.
Local do workshop & Computacional: Auditório Sônia Andrade, Pavilhão Aluízio Prata, Instituto Gonçalo Moniz – Fiocruz Bahia, Rua Waldemar Falcão 121, Brotas, Salvador-BA.
Local laboratorial: LACEN-BA, Rua Waldemar Falcão, 123 – Horto Florestal, Salvador-BA, 40295-010.
| Dia | Período | Atividade | Facilitador |
|---|---|---|---|
| 1 | Manhã | Workshop REVIGET: 08:30–09:00: Credenciamento (MSc. Alex Brito, Dr. Hendor de Jesus) 09:00–09:05: Abertura (Dra. Theolis Bessa) 09:05–09:15: Mesa 09:15–09:45: P1 “Consolidação da REVIGET N/NE…” (Dra. Karla Lima) 09:45–10:00: P2 “Situação da Tuberculose no Brasil e na Bahia” (Dra. Eliana Matos) 10:00–10:15: P3 “Diagnóstico de Micobactérias e NGS” (Dra. Theolis Bessa) 10:15–10:30: Coffee-Break 10:30–10:45: P4 “NGS a partir do Escarro” (Davi Marcon) 10:45–10:55: Q&A (Dra. Theolis Bessa) 10:55–11:00: Encerramento (Dra. Theolis Bessa, Dra. Karla Lima) |
Grupo REVIGET e convidados |
| Tarde | Inativação da bactéria, extração do DNA e Qubit. | Alex e Davi | |
| 2 | Manhã | Teoria (Apresentação Illumina); Prática (normalização do DNA e início do preparo de biblioteca para 16 amostras). | Gustavo (Illumina) |
| Tarde | Continuação do preparo de biblioteca para 16 amostras; Finalização e controle de qualidade. | Gustavo | |
| 3 | Manhã | Preparo de bibliotecas para 10 amostras extras. | Alex e Davi |
| Tarde | Desnaturação do pool de bibliotecas e PhiX; preparo da solução de sequenciamento; configuração do MiSeq e início do sequenciamento. | Alex e Gustavo | |
| 4 | Manhã | Bioinformática: Introdução a computadores. | Hendor |
| Tarde | Bioinformática: Pipelines e sessão interativa. | Hendor | |
| 5 | Manhã | Bioinformática: Pipeline MAGMA. |